風冷冷水機組:

風冷冷水機組使用管殼式蒸發器在水和制冷劑之間進行熱交換。制冷劑系統吸收水中的熱負荷并冷卻水產生冷水后，熱量在壓縮機的作用下被帶到翅片式冷凝器，然后通過冷卻風扇(空氣冷卻)消散到外部空空氣中。

水冷冷水機組:

水冷冷水機組使用管殼式蒸發器在水和制冷劑之間交換熱量。制冷劑系統吸收水中的熱負荷并使水冷卻產生冷水后，熱量在壓縮機的作用下被帶到管殼式冷凝器，制冷劑與水進行熱交換，使水吸收熱量后通過水管(水冷)帶出外冷卻塔進行散熱。

兩者的區別:

風冷冷水機組和水冷冷水機組的主要區別在于冷凝器。風冷冷水機使用風扇作為散熱。一般采用翅片式冷凝器，翅片其實指的是鋁片，即在需要換熱的部位外裝鋁片，實現高效散熱，然后用強力風扇將熱空氣抽出。與風冷冷水機組不同，水冷式冷水機組的冷凝器主要通過循環冷卻水帶走熱量，因此水冷式冷水機組的冷凝器也俗稱水炮。

相同功率的壓縮機，水冷式冷水機比風冷式冷水機的制冷功率要大些，從這個角度講，肯定是水冷冷水機好。
但從實際使用方面來說，就要看用戶的使用情況了。水冷機要接冷卻水塔，安裝位置固定后就不方便移動了。風冷式冷水機自帶散熱裝置，不需要外接冷卻水，方便移動。因此，如果使用過程中要經常移動的情況，選擇風冷式冷水機比較好。
另外一種情況，如在西部或者北方容易起沙塵的地方，使用普通冷卻水塔起冷卻水容易受沙塵污染，需要使用閉式水塔+水冷冷水機一起使用，而這兩者的總價要比風冷式冷水機的成本高。因此，使用風冷式冷水機成本上比較劃算。
還有其它很多種情況，在這里就不一一舉例了。總之，選擇水冷冷水機，還是風冷冷水機，最終還是要結合自身的實際情況來合計。